MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus HVE10/4 chromosome

Total Repeats: 58669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017275	GT	3	6	24	29	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017275	ATT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017275	GTCAC	2	10	202	211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017275	ATT	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017275	TAA	2	6	279	284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017275	T	8	8	290	297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017275	TATT	2	8	372	379	25 %	75 %	0 %	0 %	385772021
8	NC_017275	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772021
9	NC_017275	TAT	2	6	425	430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772021
10	NC_017275	ATT	2	6	466	471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772021
11	NC_017275	GTT	2	6	486	491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385772021
12	NC_017275	GTT	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385772021
13	NC_017275	CTT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385772021
14	NC_017275	TTAC	2	8	547	554	25 %	50 %	0 %	25 %	385772021
15	NC_017275	GGT	2	6	713	718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385772022
16	NC_017275	A	6	6	733	738	100 %	0 %	0 %	0 %	385772022
17	NC_017275	AG	3	6	788	793	50 %	0 %	50 %	0 %	385772022
18	NC_017275	TGC	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385772022
19	NC_017275	GTAA	2	8	896	903	50 %	25 %	25 %	0 %	385772022
20	NC_017275	GAG	2	6	923	928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385772022
21	NC_017275	ATGAGG	2	12	936	947	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385772022
22	NC_017275	TGG	2	6	991	996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385772022
23	NC_017275	TAT	2	6	1011	1016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772022
24	NC_017275	GATAA	2	10	1085	1094	60 %	20 %	20 %	0 %	385772022
25	NC_017275	ATA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772022
26	NC_017275	AGAGG	2	10	1155	1164	40 %	0 %	60 %	0 %	385772022
27	NC_017275	AT	3	6	1206	1211	50 %	50 %	0 %	0 %	385772022
28	NC_017275	TTA	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772022
29	NC_017275	ATC	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385772022
30	NC_017275	ACG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385772022
31	NC_017275	AAC	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385772022
32	NC_017275	TAA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772022
33	NC_017275	ATG	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772022
34	NC_017275	AGC	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385772022
35	NC_017275	AGCT	2	8	1464	1471	25 %	25 %	25 %	25 %	385772022
36	NC_017275	G	6	6	1478	1483	0 %	0 %	100 %	0 %	385772022
37	NC_017275	AG	3	6	1531	1536	50 %	0 %	50 %	0 %	385772022
38	NC_017275	CCTT	2	8	1558	1565	0 %	50 %	0 %	50 %	385772022
39	NC_017275	AAG	2	6	1585	1590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772022
40	NC_017275	AGA	2	6	1603	1608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772022
41	NC_017275	TAA	2	6	1645	1650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772022
42	NC_017275	CAAA	2	8	1654	1661	75 %	0 %	0 %	25 %	385772022
43	NC_017275	AGA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772022
44	NC_017275	ATA	2	6	1691	1696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772022
45	NC_017275	TGG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385772022
46	NC_017275	AAG	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772022
47	NC_017275	GTATTG	2	12	1830	1841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385772022
48	NC_017275	TGA	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772022
49	NC_017275	AGA	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772023
50	NC_017275	AGA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772023
51	NC_017275	CTA	2	6	1985	1990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385772023
52	NC_017275	GGA	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385772023
53	NC_017275	AAG	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772023
54	NC_017275	AT	3	6	2030	2035	50 %	50 %	0 %	0 %	385772023
55	NC_017275	AAG	3	9	2087	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772023
56	NC_017275	GAA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772023
57	NC_017275	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772023
58	NC_017275	ATT	2	6	2136	2141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772023
59	NC_017275	ATT	2	6	2157	2162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772023
60	NC_017275	ATT	2	6	2167	2172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772023
61	NC_017275	TAAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017275	TA	5	10	2229	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017275	ATA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772024
64	NC_017275	TAT	2	6	2312	2317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772024
65	NC_017275	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772024
66	NC_017275	TAA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772024
67	NC_017275	TA	3	6	2367	2372	50 %	50 %	0 %	0 %	385772024
68	NC_017275	TAGG	2	8	2410	2417	25 %	25 %	50 %	0 %	385772024
69	NC_017275	AGA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772024
70	NC_017275	CTTT	2	8	2508	2515	0 %	75 %	0 %	25 %	385772024
71	NC_017275	AGC	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385772024
72	NC_017275	ATT	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772024
73	NC_017275	GAT	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772024
74	NC_017275	TAA	2	6	2674	2679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772024
75	NC_017275	TGC	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385772024
76	NC_017275	AAT	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772024
77	NC_017275	TGC	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385772024
78	NC_017275	GCA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385772024
79	NC_017275	TGAT	2	8	2833	2840	25 %	50 %	25 %	0 %	385772024
80	NC_017275	TA	3	6	2913	2918	50 %	50 %	0 %	0 %	385772024
81	NC_017275	AATTGC	2	12	2930	2941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772024
82	NC_017275	AAT	2	6	2975	2980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772024
83	NC_017275	T	6	6	3095	3100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017275	T	6	6	3119	3124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017275	GGTT	2	8	3170	3177	0 %	50 %	50 %	0 %	385772025
86	NC_017275	GAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772025
87	NC_017275	AAG	2	6	3203	3208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772025
88	NC_017275	CAAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	0 %	25 %	385772025
89	NC_017275	ATC	3	9	3282	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385772025
90	NC_017275	TAT	2	6	3305	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772025
91	NC_017275	AAC	2	6	3331	3336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385772025
92	NC_017275	GGA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385772025
93	NC_017275	TGA	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772025
94	NC_017275	AAG	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772026
95	NC_017275	AGAA	2	8	3502	3509	75 %	0 %	25 %	0 %	385772026
96	NC_017275	CCA	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385772026
97	NC_017275	TTTA	2	8	3543	3550	25 %	75 %	0 %	0 %	385772026
98	NC_017275	TCC	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385772026
99	NC_017275	TCCTT	2	10	3690	3699	0 %	60 %	0 %	40 %	385772026
100	NC_017275	TTA	2	6	3716	3721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772026
101	NC_017275	ACTA	2	8	3768	3775	50 %	25 %	0 %	25 %	385772026
102	NC_017275	TTG	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385772026
103	NC_017275	TAT	3	9	3801	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385772026
104	NC_017275	T	6	6	3809	3814	0 %	100 %	0 %	0 %	385772026
105	NC_017275	A	6	6	3823	3828	100 %	0 %	0 %	0 %	385772026
106	NC_017275	TAA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772026
107	NC_017275	TAG	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772026
108	NC_017275	A	6	6	3919	3924	100 %	0 %	0 %	0 %	385772026
109	NC_017275	CGTTA	2	10	3933	3942	20 %	40 %	20 %	20 %	385772026
110	NC_017275	T	6	6	3989	3994	0 %	100 %	0 %	0 %	385772026
111	NC_017275	TCC	2	6	4006	4011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385772027
112	NC_017275	CTT	2	6	4051	4056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385772027
113	NC_017275	CATT	2	8	4068	4075	25 %	50 %	0 %	25 %	385772027
114	NC_017275	TC	3	6	4121	4126	0 %	50 %	0 %	50 %	385772027
115	NC_017275	TC	3	6	4157	4162	0 %	50 %	0 %	50 %	385772027
116	NC_017275	CCTCTG	2	12	4348	4359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385772027
117	NC_017275	CTGTG	2	10	4364	4373	0 %	40 %	40 %	20 %	385772027
118	NC_017275	AAG	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772027
119	NC_017275	CCA	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385772027
120	NC_017275	GTAAT	2	10	4510	4519	40 %	40 %	20 %	0 %	385772027
121	NC_017275	AAT	2	6	4552	4557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772027
122	NC_017275	GTTTT	2	10	4584	4593	0 %	80 %	20 %	0 %	385772027
123	NC_017275	TC	3	6	4627	4632	0 %	50 %	0 %	50 %	385772027
124	NC_017275	AGG	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385772027
125	NC_017275	TAT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017275	TCT	2	6	4794	4799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385772028
127	NC_017275	TACG	2	8	4832	4839	25 %	25 %	25 %	25 %	385772028
128	NC_017275	TA	3	6	4846	4851	50 %	50 %	0 %	0 %	385772028
129	NC_017275	ATTGAT	2	12	4856	4867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772028
130	NC_017275	CTT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385772028
131	NC_017275	TAA	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772028
132	NC_017275	CTAAA	2	10	4927	4936	60 %	20 %	0 %	20 %	385772028
133	NC_017275	CCT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385772028
134	NC_017275	CAT	2	6	5095	5100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385772028
135	NC_017275	CTTAT	2	10	5133	5142	20 %	60 %	0 %	20 %	385772028
136	NC_017275	AT	3	6	5141	5146	50 %	50 %	0 %	0 %	385772028
137	NC_017275	TCT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385772028
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396	NC_017275	ATA	2	6	16966	16971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772039
397	NC_017275	TTTC	2	8	17019	17026	0 %	75 %	0 %	25 %	385772039
398	NC_017275	CCATG	2	10	17062	17071	20 %	20 %	20 %	40 %	385772039
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